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Illumina HiSeq 1500测序系统中文介绍

产品概述

HiSeq 1500是美国Illumina公司推出的高通量二代测序系统，属于HiSeq系列早期型号，采用经典的边合成边测序（SBS）技术，支持单流动槽（Flow Cell）运行，适用于中等规模基因组测序项目。该系统于2010年发布，与HiSeq 2500共享技术平台，但仅支持单流动槽配置，适合预算有限且需平衡通量与成本的实验室。

核心技术特点

1. 双模式灵活运行

   • 高产量模式：单次运行可产生最高300 Gb数据（2×100 bp读长），运行时间约8.5天，适用于全基因组、外显子组等大规模测序。
   • 快速运行模式：通过内置簇生成技术（On-board Cluster Generation）加速流程，27小时内可完成60 Gb数据输出（2×100 bp），适合快速获取结果的临床或紧急研究项目。
   • 采用可逆终止子SBS技术，碱基识别准确率高（2×100 bp时≥80%碱基高于Q30），显著降低同聚物测序错误。

2. 模块化设计

   • 流动槽含8条泳道（Lane），每条Lane可独立上样，支持多样本并行处理。
   • 兼容Illumina标准文库构建方案（如TruSeq、Nextera），适配全基因组、转录组、靶向捕获等多种应用。

3. 数据质量与效率

   • 单次运行可生成最多30亿条末端配对读取（高产量模式），数据通量满足中等规模研究需求。
   • 集成BaseSpace云计算平台，支持实时数据分析和存储，简化生信流程。

典型应用场景

• 人类基因组研究：30×覆盖度的全基因组测序可在快速模式下27小时内完成。
• 临床诊断：兼容无创产前检测（NIPT）、肿瘤基因突变筛查等，数据符合临床级质量标准。
• 微生物组与转录组：适用于16S rRNA测序、mRNA表达谱分析等。

行业定位与局限性

HiSeq 1500凭借高性价比和稳定性成为早期中高通量测序的主力机型，但后续被HiSeq 2500/4000及NovaSeq系列取代。其局限性包括：

• 仅支持单流动槽，通量低于HiSeq 2500的双槽配置。
• 读长较短（最长2×150 bp），对复杂基因组组装存在挑战。

注：目前HiSeq 1500已停产，二手市场价格约200万-500万人民币，适合预算有限的科研机构。